『柳営補任』によると、嘉永～慶応にかけて就任者はのべ25名（大名1名、旗本24名）。再任を除くと24名（大名1名、旗本23名）。在任期間が最も長いのは荒尾成允
長崎奉行就任者一覧（嘉永～慶応）
平賀勝足（弘化3年閏5月6日～嘉永元年5月26日）
稲葉正申（嘉永元年5月26日～嘉永元年10月3日）
大屋明啓（嘉永元年11月1日～嘉永3年5月25日）
一色直休（嘉永3年7月8日～嘉永3年11月29日）
牧義制（嘉永3年11月29日～嘉永6年4月28日）
水野忠徳（嘉永6年4月28日～安政元年12月24日）
川村修就（安政2年5月1日～安政4年1月22日）
大久保忠寛（安政4年1月22日～安政4年4月15日）
水野忠徳（安政4年4月25日～安政4年12月3日）
岡部長常（安政4年12月28日～文久元年11月16日）
大久保忠恕（文久2年6月5日～元治元年6月17日）
大村純煕（文久3年6月～元治元年9月11日）大名
杉浦勝静（文久3年7月23日～文久3年7月29日）
京極高朗（文久3年9月8日～文久3年11月28日）
朝比奈昌広（元治元年10月11日～慶応2年6月15日）
徳永昌新（慶応2年3月7日～慶応3年12月12日）
井戸覚弘（弘化2年12月3日～嘉永2年8月4日）
内藤忠明（嘉永2年9月24日～嘉永5年5月15日）
大沢乗哲（嘉永5年5月15日～嘉永7年5月9日）
荒尾成允（嘉永7年5月9日～安政6年9月10日）
朝比奈昌寿（文久元年3月22日～文久元年5月12日）
高橋和貫（文久元年5月12日～文久2年8月16日）
服部常純（文久3年4月26日～慶応2年8月12日）
能勢頼之（慶応元年8月10日～慶応3年12月12日）
河津祐邦（慶応3年8月15日～慶応4年1月24日）